l、两者依据不同
竣工决算审计依据《审计法》和审计署发《基本建设竣工决算审计工作要求》进行，基建审计内容为：

（1）竣工决算编制依据；

（2）项目建设及概（预）算执行情况；

（3）建设成本；

（4）交付使用资产；

（5）尾工工程；

（6）结余资金；

(7）基建收入；

（8）投资包干结余；

（9）投资效益评价。
主要根据国家的审计法和相关规定，对建设项目竣工决算进行审计，主要审查概（预〕算在执行中是否超支，超支原因，有元隐匿资金；隐瞒或截留基建收人和投资包干结余、以及以投资包干结余名义分基建投资之类的违纪行为等等。
工程造价审店主要是根据国家有关法规和政策，依据国家建设行政主管部门颁发的工程定额I、工程消耗标准、取费标准以及人工、材料、机械台册价格参数、设周一图纸和工程实物量，村工程造价的确人和控制进行有效的监督检查。

在工程项目实施阶段，以承包合同为基础，在竣工验收后结合施工变更、工程签证。情况，作出符合施工实际的竣工造价中查结果，它是承发包双方结算的依据，也是工程决算的基础资料和依据。